Institut Méditerranéen d’Ecologie et de Paléoécologie (imep), Marseille








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Formation universitaire

Depuis octobre 1998 Maître de Conférences

Institut Méditerranéen d’Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Marseille

Ecologie des populations végétales - Espèces rares/endémiques et envahissantes

1997 –1998 Assistante-Professeur

Institut de Botanique, Laboratoire de Phanérogamie, Neuchâtel (Suisse)

1996 - 1997 Stage post-doctoral

Institut de Botanique, Laboratoire de Phanérogamie, Neuchâtel (Suisse)

Financement : European Science Foundation

Septembre 1992 - Février 1996 Doctorat en Sciences

Université des Sciences François Rabelais, Tours & Centre d'Ecologie Evolutive et Fonctionnelle (CEFE - CNRS), Montpellier

Spécialité : Biologie des Populations

Mention : Très Honorable avec les Félicitations du Jury

Financement : Ministère de la Recherche et de la Technologie

Directeurs : J. D. Thompson et M. Debussche

Sujet : Variation du système de reproduction et structuration génétique des populations chez quatre espèces du genre Cyclamen (Primulaceae)

1991-1992 DEA Biologie des Populations et Eco-éthologie

Université des Sciences François Rabelais, Tours

1990-1991 Maîtrise Biologie des Populations et des Organismes

1989-1990 Licence Biologie des Populations et des Organismes

1987-1989 DEUG B Sciences de la Vie et de la Nature

Université de Montpellier II, Montpellier

1986-1987 Baccalauréat Série D Lycée de Mazamet, Tarn
Publications scientifiques

La liste des publications comprend 28 articles indexés dans des revues scientifiques à comité de lecture (dont 7 signés en 1er auteur), 7 articles non indexés dans des revues scientifiques à comité de lecture, 6 chapitres dans des ouvrages collectifs, 4 actes de colloque.

Publications indexées dans des revues à comité de lecture

Revue scientifique (ordre alphabétique)

Nombre d’articles

Facteur d’Impact (ISI-JCR 2009)

Acta Botanica Gallica

4

0.064

American Journal of Botany

1

2.684

Annals of Botany

2

3.501

Biological invasions

1

3.074

Biological Journal of the Linnean Society

2

2.040

Botanical Journal of the Linnean Society

1

0.984

C.R. Biologies

2

1.712

Ecology

1

4.874

Ecological Indicators

1

2.967

Evolutionary Ecology

1

3.193

Flora

1

1.657

Folia Geobotanica

1

1.320

Heredity

3

4.122

Journal of Evolutionary Biology

1

3.816

Plant Molecular Biology Reporter

1

0.711

Plant and Soil

1

2.517

Plant Systematics and Evolution

1

1.410

Population Ecology

1

1.539

Taxon

2

2.747

Total

26





(noms soulignés = Doctorants/DES/M2R sous mon co-encadrement)
Baumberger T., Mesléard F., Croze T. & Affre L. soumis. Effects of submersion on survival, growth, and biomass allocation according to development stages of the rare halophyte Limonium girardianum. Aquatic Botany.

Baumberger T., Croze T., Mesléard F. & Affre L. in press. Habitat requirements and population structure of the rare endangered Limonium girardianum in industrialized salt marshes. Flora.

Baumberger T., Affre L., Torre F., Vidal E., Dumas P.J. & Tatoni T. 2011. Plant community changes as ecological indicator of seabird colonies’ impact on Mediterranean Islands. Ecological Indicators, 15(1): 76-84.

Saatkamp A., Affre L., Baumberger T., Dumas P.J., Gasmi A., Gachet S. & Arène F. 2011. Soil depth detection by seeds and diurnally fluctuating temperatures: different dynamics in 10 annual plants. Plant and Soil, in press.

Youssef S., Baumel A., Véla E., Juin M., Dumas E., Affre L. & Tatoni T. 2011. Factors underlying the narrow distribution of the Meditteranean annual plant Arenaria provincialis (Caryophyllaceae). Folia Geobotanica, in press.

Saatkamp A., Affre L., Dutoit T. & Poschlod P. 2011. Germination traits explain soil seed persistence across species - the case of Mediterranean annual plants in cereal fields. Annals of Botany. 107(3): 415-426.

Verlaque R., Affre L., Diadema K., Suehs C.M. & Médail F. 2011. Unexpected morphological and karyological changes in invasive Carpobrotus (Aizoaceae) in Provence (S-E France) compared to native South African species. C.R. Biologies, 334: 311-319.

Affre L., Suehs C.M., Charpentier S., Vilà M., Brundu G., Lambdon P., Traveset A., & Hulme P.E. 2010. Consistency on the habitat degree of invasion for three invasive plant species across Mediterranean islands. Biological Invasions, 12: 2537-2548.

Saatkamp A., Affre L., Dutoit T. & Poschlod P. 2009. The seed bank longevity index revisited - limited reliability evident from a burial experiment and database analyses. Annals of Botany, 104(4): 715-724.

Campagne P., Baumel A., Affre L., Juin M., Duong N., Roche P., Tatoni T. 2009a. Genetic signs of connectivity in Primula vulgaris (Primulaceae) in a hedgerow network landscape. C.R. Biologies, 332: 652-661.

Campagne P., Affre L., Baumel A., Roche P. & Tatoni T. 2009b. Fine scale response to landscape structure in Primula vulgaris Huds.: Does hedgerow network connectedness ensure connectivity through gene flow?. Population Ecology, 51: 209-219.

Baumel A., Affre L., Véla E., Auda P., Torre F., Youssef S. & Tatoni T. 2009. Ecological magnitude and fine scale dynamics of the mediterranean narrow endemic therophyte, Arenaria provincialis (Caryophyllaceae). Acta Botanica Gallica, 156(2): 259-272.

Diadema K., Médail F., Castagné H., Affre L., Roux J.P. & Bretagnolle F. 2007. Ecologie, distribution et morphologie comparées des nivéoles de Nice (Acis nicaeensis) et de Fabre (Acis fabrei), Alliaceae endémiques des Alpes maritimes et de la Nesque (Vaucluse). Acta Botanica Gallica, 154(4): 619-634.

Suehs C.M., Charpentier S., Affre L. & Médail F. 2006. The evolutionary potential of invasive Carpobrotus (Aizoaceae) taxa: are pollen-mediated gene flow potential and hybrid vigor levels connected ? Evolutionary Ecology, 20: 447-463.

Diadema K., Bretagnolle F., Affre L., Yuan Y.M., & Médail F. 2005. Geographic structure of molecular variation of Gentiana ligustica (Gentianaceae) in the Maritime and Ligurian regional hotspot, inferred from ITS sequences. Taxon, 54(4): 887-894.

Thompson J.D., Lavergne S., Affre L., Gaudeul M. & Debussche M. 2005. Ecological differentiation of Mediterranean endemic plants. Taxon, 54(4): 967-976.

Suehs C.M., Affre L. & Médail F. 2005. Unexpected insularity effects in invasive plant mating systems: the case of Carpobrotus (Aizoaceae) taxa in the Mediterranean Basin. Biological Journal of the Linnean Society, 85: 65-79.

Suehs C.M., Affre L. & Médail F. 2004a. Invasion dynamics of two alien Carpobrotus (Aizoaceae) taxa on a Mediterranean Island: I. Genetic diversity and introgression. Heredity, 92: 31-40.

Suehs C.M., Affre L. & Médail F. 2004b. Invasion dynamics of two alien (Aizoaceae) taxa on a Mediterranean Island: II. Reproductive strategies. Heredity, 93: 1-7.

Diadema K., Baumel A., Le Bris M. & Affre L. 2003. Genomic DNA isolation and amplification from callus culture for DNA isolation in succulent plants, Carpobrotus sepcies. Plant Molecular Biology Reporter, 21: 1-5.

Affre L. & Thompson J.D. 1999. Variation in self-fertility, inbreeding depression and levels of inbreeding in four Cyclamen species. Journal of Evolutionary Biology, 12: 113-122.

Affre L. & Thompson J.D. 1998. Floral trait variation and covariation within and among four Cyclamen (Primulaceae) species. Plant Systematics and Evolution, 212: 279-293.

Affre L., Thompson J.D. & Debussche M. 1997. Genetic structure of continental and island populations of the Mediterranean endemic Cyclamen balearicum (Primulaceae). American Journal of Botany, 84: 437-451.

Affre L. & Thompson J.D. 1997. Variation in the population genetic structure of two Cyclamen species on the island of Corsica. Heredity, 78: 205-214.

Affre L. & Thompson J.D. 1997. Population genetic structure and levels of inbreeding depression in the Mediterranean island endemic Cyclamen creticum (Primulaceae). Biological Journal of the Linnean Society, 60: 527-549.

Thébaud C., Finzi A.C., Affre L., Debussche M. & Escarré J. 1996. Assessing why two introduced Conyza differ in their ability to invade Mediterranean old fields. Ecology, 77: 791-804.

Debussche M., Grandjanny M., Debussche G. & Affre L. 1996. Ecologie d'une espèce endémique et rare à distribution fragmentée : Cyclamen balearicum Willk. en France. Acta Botanica Gallica, 143: 65-84.

Affre L., Thompson J.D. & Debussche M. 1995. The reproductive biology of the Mediterranean endemic Cyclamen balearicum Willk. (Primulaceae). Botanical Journal of the Linnean Society, 118: 309-330.

Debussche M., Debussche G. & Affre L. 1995. La distribution fragmentée de Cyclamen balearicum Willk. en France : analyse historique et conséquence des activités humaines. Acta Botanica Gallica, 142: 439-450.
Publications non indexées dans des revues à comité de lecture

Baumberger T., Croze T., Affre L. & Mesléard F. in press. Co-occurring species indicate rare species' habitats: the case of Limonium girardianum. Plant Ecology and Evolution.

Laffont-Schwob I., Dumas P.J., Pricop A., Rabier J., Miché L., Affre L., Masotti V., Prudent P. & Tatoni T. 2011. Insights on metal-tolerance and symbionts of the rare species Astragalus tragacantha aiming at phytostabilization of polluted soils and plant conservation. Ecologia Mediterranea, 37(2): 57-62.

Hardion L., Baumel A., Dumas P.J., Duong N., Affre L., Tatoni T. 2010. Phylogenetic relationships and infrageneric classification of Astragalus tragacantha L. (Fabaceae), inferred from nuclear ribosomal DNA Internal transcribed spacers data (nrDNA ITS). Ecologia Mediterranea, 36: 99-106.

Suehs C.M., Affre L. & Médail F. 2004. Dynamique d'invasion de deux végétaux introduits dans le bassin méditerranéen, Carpobrotus spp (Aizoaceae) sur l’île de Bagaud (Parc National de Port-Cros, S.E. France) : hybridation, structure clonale et stratégies de reproduction. Scientific Reports of the Port-Cros National Park, 20: 19-46.

Thompson J.D., Debussche M. & Affre L. 2001. Ecological and evolutionary aspects of population differentiation in three related Cyclamen species in the western Mediterranean. Bocconea, 13: 165-172.

Barroit A., Gerbaud E., Affre L. & Raquet, V. 2000. Stratégies de reproduction et de dispersion des graines chez les espèces messicoles: implications pour leur conservation dans le Parc naturel régional du Luberon. Courrier Scientifique du Parc naturel régional du Luberon, 4: 128-142.

Bretagnolle F., Gory G. & Affre L. 1995. Deux nouveaux sites de nidification du martinet pâle (Apus pallidus) en France continentale. Alauda, 63: 101-103.
Chapitres d’ouvrage

Affre L. 2011. Ecological and Evolutionary Insights from Plant Invasions: The Case of Carpobrotus spp. (Aizoaceae) in the Mediterranean Basin. In: Berhardt L.V. (ed). Advances in Medicine and Biology. Volume 16. Nova Science Publishers, Hauppauge, NY, USA, in press.

Affre L. & Médail F. 2010. Les griffes de sorcière (Carpobrotus spp.) en France méditerranéenne. In: Barbault R. & Atramentowicz M. (eds.). Les invasions biologiques, une question de natures et de sociétés. Editions Quae, Paris, pp. 27-28.

Diadema K., Médail F., Affre L., Castagné H., Torre F. & Bretagnolle F. 2004. Ecology and demography of two endangered narrow endemic plants (Leucojum, Amaryllidaceae) in southern France. In: Arianoutsou M. & Papanastasis V.P. (eds.). Ecology, Conservation and Management of Mediterranean climate ecosystems. Millpress Science Publishers, Rotterdam, pp 1-9.

Médail F., Affre L. & Suehs C.M. 2004. Carpobrotus sp. [C. edulis (L.) N.E. Br., C. aff. acinaciformis (L.) L. Bolus], les griffes-de-sorcière. In: Muller S. (ed.). Plantes invasives en France. Collection Patrimoines Naturels vol. 62, Publications scientifiques du Muséum National d’Histoire Naturelle, Paris, pp. 52-55.

Suehs C.M., Medail M. & Affre L. 2001. Ecological and genetic features of the invasion by the alien Carpobrotus (Aizoaceae) plants in Mediterranean island habitats. In: Brundu G., Brock J., Camarda I., Child L., Wade M. (eds). Plants invasions: Species ecology and ecosystem management. Backhuys Publishers, Leiden, p. 145-158.

Suehs C.M., Médail F. & Affre L. 2003. Invasion by South African Carpobrotus (Aizoaceae) taxa in the Mediterranean basin: the effects of islands on plant reproductive systems. In: Child. L.E., Brock J.H., Brundu G., Brach K., Pysek P., Wade P.M. & Williamson M. et al. (eds.). Plant Invasions : ecological threats and management solutions. Backhuys Publisher, Leiden, pp. 247-263.
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