THÈse pour le diplôme d’État








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F.Bactériologie



Parmi les 186 dossiers étudiés, 47 patientes, soit 25.2%, n’ont pas eu d’ECBU réalisé au SAU (dont 6 dossiers de consultation post-urgence comptés comme n’ayant pas d’ECBU car non informé, 3 patientes ayant eu un ECBU fait en ville et 2 patientes directement adressées pour le bloc opératoire) malgré une bandelette urinaire positive dans 13 cas sur 47, soit 27.6% des cas.

Il y avait donc 139 ECBU récupérés au total.

On constate que pour 17.3% des cas (n=24), il n’y avait aucun germe retrouvé au à l’examen direct de l’ECBU.

Parmi les 115 ECBU ayant un examen direct positif, et donc envoyés en culture, 12 (soit 8.6%) étaient polymicrobiens sans poursuite de l’identification et 12 (soit 8.6%) étaient rendus négatifs.

Donc, 91 ECBU ont permis de mettre en évidence un germe pathogène après la mise en culture.

1.Distribution des bactéries dans la population étudiée



Les bacilles à Gram négatif (BGN) représentaient au total 91.2% (n=83) des germes retrouvés parmi les patientes ayant un ECBU positif après mise en culture et identification. Escherichia coli était le premier agent responsable d’infection urinaire avec 81.3% des isolats, suivi Klebsiella pneumoniae (5.6%) et Proteus mirabilis (3.3%), tandis que les autres espèces de BGN étaient beaucoup moins fréquentes.

On a constaté que le Staphylococcus saprophyticus était présent dans 7.7% des cas, le plaçant en deuxième agent pathogène dans notre échantillon après E. coli.


Tableau 6 : répartition des bactéries dans l'ensemble de la population étudiée

Bactéries

Nombre (n)

Pourcentage (%)

Escherichia coli

74

81.3

Enterococcus faecalis

1

1.1

Klebsiella pneumoniae

5

5.6

Proteus mirabilis

3

3.3

Staphylococcus saprophyticus

7

7.7

Staphylococcus haemolyticus

1

1.1


2.Le cas d’E. coli



E. coli était le premier agent pathogène, responsable de 81.3% (n=74/91) des pyélonéphrites aigües de notre échantillon.

L’étude de la répartition des résultats bactériologiques des ECBU en fonction de la gravité de la pyélonéphrite aigüe a montré que E. coli était responsable de 81.3% (n=68/82 PNA sans signe de gravité ayant un ECBU positif) des PNA ne présentant pas de signe de gravité à l’arrivée au SAU.

La résistance d’E.coli aux antibiotiques testés pour l’antibiogramme était répartie comme suit :

  • 59,4% résistant à l’amoxicilline,

  • 14,5% à l’amoxicilline-acide clavulanique,

  • 59,4% à la ticarcilline,

  • 4,3% au céfotaxime,

  • 2,9% à la gentamicine,

  • 39,1% au SMX-TMP

  • 24,6% à l’acide nalidixique,

  • 20,3% à l’ofloxacine,

  • 1,45% aux furanoïdes,

  • 1,45% à la fosfomycine.



3.Etude des ECBU négatifs



Le nombre d’ECBU revenus négatifs après mise en culture était de 12 sur 115 ECBU ayant un examen direct positif.

Il n’y avait pas de différence d’âge parmi les patientes ayant eu un ECBU négatif (37,5 ans versus 38,8ans).

Parmi les 12 patientes qui avaient un ECBU négatif, 9 avaient une douleur lombaire, 7 avaient des signes fonctionnels urinaires et une BU positive, 1 avait de la fièvre.

Quant à l’ECBU, tous présentaient une leucocyturie significative.

Cinq de ces patientes avaient reçu une antibiothérapie antérieure, dont 2 prenaient un antibiotique depuis moins de 48h.

4.Etude des ECBU polymicrobiens



Le nombre d’ECBU revenus polymicrobiens après mise en culture était également de 12 sur 115 ECBU analysés.

Chez ces patientes, 11 avaient une douleur lombaire, 7 avaient des signes fonctionnels urinaires et une BU positive, 2 avaient de la fièvre.

Tous les ECBU présentaient une leucocyturie significative.

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