Rapport de stage technicien








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Baylor : IICAP1D13202


Jena : JAX4b18d11.s1 ; JC2a58b03.s1 ; JC2e77e12.r1

Homologues :
Arabidopsis thaliana : NPSN 11
Saccharomyces cerevisiae : pas d’homologue
Homo sapiens : pas d’homologue

Séquence d’acides aminés : core : 68 aa  ; TM ; intron
MNYRRVYILNSYIEEINETLSNIENELKNNCNNKEKIKKLFENVENDISLLKLEYNNNNINNNINNDPNCRVVLSKYDQLKLQFNKSQLISNETFNNNSNNQSTNFNSSTNETREKILNLNKMMDNNTKMIQSARQEISSMTTLATDLSNTLHSQTEQMKNMDKKFDSIDANIDKSPKTIDKMSKRWF

Séquence nucléique des introns :
V : gtttgtgtaataagtcgaaatatttaaaaaataatttttaaattttttttttttttcaat tttattttattttttttaatttattttatttttttttattttttttatttttcactgaatttttttcaattttacagcgggtgttacagaacacctgttttattaattttttttttttttttttattttaattttaattttaatttaatttataaaccaaactattcaaaataatatattaatgatcaatcaatatcttttataaaaccatctttttaaaataattaattaactaccataataaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatacacaaacaaatttattaatggtataattttttattattattattattctaattattattttaatccataatattaatactaatatttttatttttattttttatttttcatttttttttaaaagag

  • NPSN 1B


Longueur : 197 acides aminés
Point isoélectrique : 8.89
Poids moléculaire : 22725.49

Clones :
Baylor : IIAFP1D54660 ; IIAAP1D0949 


Jena : JC1b203b10.r1
Sanger : Sdic60f11

Homologues :
Arabidopsis thaliana : NPSN 12 ; NPSN 13
Saccharomyces cerevisiae : pas d’homologue
Homo sapiens : VTI 1A

Séquence d’acides aminés : core : 68 aa  ; TM ; intron
ILMADIIENEIELDKIIKEVEKNIKDLRKNKKDIESRGGVDLIKNRINRSKQILRSYKIDLRELPKTELAKYDSKVNDYEEQIKKLENDFNWVENIMVNNESGSSVTKQDKKITNGILQTVIETNNIGTTTLAEMNIQEEQINRIKNDMDLIDSNLKLATRQMRSIARKMATDKIILGLILLIIAGIIVVIVYKTLK

Séquence nucléique des introns :
GG : gtaataagaataaatttatttttaaataaattttttttactaatcaatttttttaaa taaataatttattaattttttttttttttttttttttttttttccaaag
K : gtaataataaaaataataatttatcaataatagtgatgataataataataataataat gaaaatttaaaaaatgatatacaatatcaaaatgtaatgaaaaaagcgaaagataag

2°) v-SNAREs
a) SEC 22
Longueur : 214 acides aminés
Point isoélectrique : 8.88
Poids moléculaire : 25165.32
Clones :

Tsukuba : SSI383 ; VSF401
Jena : JC1c281c09 ; JC1b116a08 ; JC1c77f10 ; JC1b105g12 ; JC1c153g04 ; JC1c312a04 ; JC1c305f09 ; JC1b04d02 ; JC1c81e03 ; JC1c283b06
Homologues :
Arabidopsis thaliana : SEC 22

SEC 22 – like ; VAMP 712 ; VAMP 713 ; VAMP 711 ; VAMP 714 ; VAMP 724 ; VAMP 722 ; VAMP 725
Saccharomyces cerevisiae : SEC 22
Homo sapiens : SEC 22

SYBL 1 ; VAMP 7

Séquence d’acides aminés : core : 66 aa  ; TM ; intron
MVLFAMLCRVTDGLMLSESMDTLNPTFDKYRLQAKAIISKLSRVFDKAVTVDANDKYYFAYIIEHEICYLAFCEKSYSKKLVFRFLDDLQKEFYNTYGFEVPSAKRPYQFIAFESFITKTKKLYQDTRAQKNLSNISVELDEVRNIMTKNIKDIVGRGEKLNELNDKTEFLLADSLKYEKQTVALSSKLFFKKYGPILIIAFFALFLYIYLYYF
Séquence nucléique des introns :
A : gtatgtattatttatttattaattttgctttttttttttttttttttttttttaaact ttaataattaataattaaatttatttaaag
E : gtatgtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattataatattcaatttattgattttcaatagaaaatttattaattgtttattctatttatag
E : gtaaatatttttaaattttcttaattatttcttttttttttttttttttttttttttt aaaaacacaattctcaaaacaatattttaataaaccatttttattattaattattattattattttataaaattaaag
b) VAMP


  • VAMP 3


Longueur : 95 acides aminés
Point isoélectrique : 9.72
Poids moléculaire : 10876.04

Clones :

Tsukuba : SSB132 ; SSB627 ; SSC384 ; SSC615 ; SSH266 ; SSH785 ; SSJ122 ; SSK419 ; SSK783 ; SSM361 ; SSM718 ; SSM735

Homologues :
Arabidopsis thaliana : VAMP 722 ; VAMP 721 ; VAMP 724 ; VAMP 725

VAMP 726 ; VAMP 723 ; VAMP 713 ; VAMP 727 ; VAMP 712 ; VAMP 714
Saccharomyces cerevisiae : SNC 2 ; SNC 1

NYV 1
Homo sapiens : pas d’homologue

Séquence d’acides aminés : core : 43 aa  ; TM ; intron
MSEPVNKVKQTQQQVDDVTNTMHIAVGKMLDNQQKVSELTDKSENMKQGAQQFKKKTNEIKRLMWCRNIKLTLIIIAVVVLLLVVIIVPIVLKFT

Séquence nucléique des introns :
P : gtaagtaaaggatttttttaaaaaaaagttaataacaatagtaataattaaataaata ctaattaaaatcaatatgtaccaaaaaataataataattaataaatcaatataataataataattttttag

  • VAMP 4


Longueur : 100 acides aminés
Point isoélectrique : 10.29
Poids moléculaire : 11498.68

Clones :
1   2   3   4   5   6   7   8

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