Parcours académique








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9
Aurélien Mercier

rue du Bien Être 95120 ERMONT

E-mail : aurelien.mercier@unilim.fr - 09.52.02.07.79 / 06.43.52.18.89

Né le 21 mars 1981 à Le Havre
Chercheur en Écologie et Parasitologie (Microbiologie)

PARCOURS ACADÉMIQUE



2010 Thèse, Université de Limoges (mention très honorable et félicitations du jury)
2006 Suivi en auditeur libre du Master 2 recherche Neurosciences et Parasitologie Tropicales de l’Institut d'Epidémiologie neurologique et de Neurologie Tropicale de Limoges (EA 3174, NETEC-NeuroEpidémiologie Tropicale et Comparée)
2006 D.E.S (Diplôme d’Études Supérieures) en Science de la Vie, Santé, Terre, Université Paris VI (mention très bien)
2005 Master 2 rechercheÉcologie Biodiversité Évolution, Université Paris VI (mention assez bien)
2004 Maîtrise Biologie des Organismes et des Écosystèmes, Université Paris VI (mention assez bien)
2003 Licence Biologie des Organismes et des Populations, Université Paris VI (mention assez bien)
2002 DEUG Biologie, Université du Havre (mention assez bien)
2000 Baccalauréat Scientifique

EXPÉRIENCE PROFESSIONNELLE



Mai 2011 : Mission de 3 semaines sur une étude d’épidémiologie de la toxoplasmose chez 800 rongeurs du Niger (collaboration avec Gauthier Dobigny du Centre de Biologie pour la Gestion des Populations/IRD)
2006-2010 : Thèse, Laboratoire de Parasitologie (EA 3174) : « Approche écologique, épidémiologique et génétique de la biodiversité de Toxoplasma gondii en zone tropicale humide: exemple du Gabon et de la Guyane Française » sous la direction du Pr. Marie-Laure Dardé (faculté de Médecine de Limoges). ED 523 Sciences pour l’Environnement
2005-2006 : D.E.S, Laboratoire de Parasitologie de la Faculté de Médecine de Limoges au sein de l'EA 3174 : « Préparation d'une étude d'épidémiologie moléculaire de Toxoplasma gondii en Afrique» sous la direction du Pr. Marie-Laure Dardé
2004-2005 : Master 2 recherche, Laboratoire LBSE (UMR Biosol, Université Paris XII, Paris VI, IRD) : « Caractérisation de marqueurs microsatellites chez Labiotermes labralis (Termitidae : Nasutitermitinae) en vue de tester l’impact de la fragmentation forestière en Guyane» sous la direction du Pr. Myriam Harry

ACTIVITÉS D’ENSEIGNEMENT



2009-2010 : ATER ½ poste section 67, faculté des sciences et technique de Limoges.

Enseignements dispensés (112,5h cours/TD/TP niveau L1, L2 et L3) :

  • Introduction à la diversité du vivant (21h TD, L1)

  • Diversité et évolution du monde animal (11h cours, L2)

  • Biologie du développement (21h TP, L2)

  • Biologie et écologie (13,5h TD, L2)

  • Expérimentation en écologie des organismes (27h TP, L3)

  • Génétique et dynamique des populations (7h cours et 12h TD, L3)

ENCADREMENT D’ÉTUDIANTS



2009-2010 : Frédérique Collinet (M2 recherche, Université de Limoges) : « Structuration spatiale de la population de Toxoplasma gondii à l’origine de toxoplasmose congénitale humaine en France »

PUBLICATIONS DANS DES REVUES À COMITÉ DE LECTURE



Acceptées
Mercier A, Devillard S, Ajzenberg D, Pierre Demar M, de Thoisy B, Bonnabau H, Collinet F, Boukhari R, Blanchet D, Simon S, Carme B, Dardé ML. Human impact on genetic diversity of Toxoplasma gondii: example of the anthropized environment from French Guiana. Infection Genetics Evolution. DOI:10.1016/j.meegid.2011.05.003. Sous presse.
Mercier A., Devillard S, Ngoubangoye B, Bonnabau H, Bañuls AL, Durand P, Sallé B, Ajzenberg D, Dardé ML (2010) Additional Haplogroups of Toxoplasma gondii out of Africa: Population structure and mouse-virulence of strains from Gabon. Plos Neglected Tropical Diseases 4(11): e876. DOI:10.1371/journal.pntd.0000876.
Ajzenberg D, Collinet F, Mercier A, Vignole P, Dardé ML (2010) Genotyping of Toxoplasma gondii isolates with 15 microsatellite markers in a single multiplex PCR assay. Journal of Clinical Microbiology DOI:10.1128/JCM.01152-10.
Richomme C, Aubert D, Gilot-Fromont E, Ajzenberg D, Mercier A, Ducrot C, Ferté H, Delorme D, Villena I (2009) Genetic characterization of Toxoplasma gondii from wild boar (Sus scrofa) in France. Veterinary Parasitology 164: 296-300.
Harry M, Dupont L*, Romana C*, Demanche C*, Mercier A*, Livet A, Diotaiuti L, Noireau F, Emperaire L (2008) Microsatellite markers in Triatoma pseudomaculata (Hemiptera, Reduviidae, Triatominae), Chagas disease vector in Brazil. Infection Genetics Evolution 8(5): 672-675.*Contribution égale de ces auteurs à ce travail.
Harry M, Roy V, Mercier A, Livet A, Garnier E, Bousserrhine N, Demanche C (2006) Isolation and characterization of microsatellite markers in Labiotermes labralis (Isoptera, Termitidae, Nasutitermitinae). Molecular Ecology Notes 7(1): 121-123.
Dumètre A., Ajzenberg D., Rozette L., Mercier A., Dardé ML (2006) Toxoplasma gondii infection in sheep from Haute-Vienne, France: seroprevalence and isolate genotyping by microsatellite analysis. Veterinary Parasitology 20: 376-379.
En préparation
Mercier A, Ajzenberg D, de Thoisy B, Carme B, Dardé ML Note: Highlight of the potential contamination source, four years later after an outbreak of toxoplasmosis in a captive breeding colony of squirrel monkeys in French Guiana.
Ajzenberg D, Mercier A, Carme B, Demar M, Dardé ML Revue sur la toxoplasmose Guyanaise. Médecine/Sciences.
Carme B, Demar M, Mercier A, Ajzenberg D, Dardé ML Amazonian toxoplasmosis.
Dar Y, Amer S, Mercier A, Courtioux B, Dreyfuss G PCR-RFLP analysis of Fasciola spp. in Egypt. Journal of Helminthology. Soumis.

COMMUNICATIONS ORALES / COMMUNICATIONS AFFICHÉES



Communications orales
Mercier A, Devillard S, Ajzenberg D, Pierre Demar M, de Thoisy B, Bonnabau H, Collinet F, Boukhari R, Blanchet D, Simon S, Carme B, Dardé ML. L’impact humain sur la diversité génétique de Toxoplasma gondii : exemple de l’environnement anthropisé de la Guyane française. Congrés conjoint de la Société Française de Mycologie Médicale, de la Société Française de Parasitologie et du Groupement des Protistologues de Langue Française, Strasbourg, 18-20 Mai 2011.
Mercier A, Ngoubangoye B, Pourrut X, Salle B, Bisvigou U, Akué JP, Dardé ML. Human and animal seroprevalence of Toxoplasma gondii comparison between a rural and urban area in Gabon. 10th European Multicoloqium of parasitology, Paris, 24-28 Août 2008.
Mercier A, Ngoubangoye B, Salle B, Jaffré N, Ajzenberg D, Dardé ML. Population structure of Toxoplasma gondii in Gabon. 10th European Multicoloqium of parasitology, Paris, 24-28 Août 2008.
Mercier A, Ngoubangoye B, Salle B., Jaffré N, Bisvigou U, Ajzenberg D., Dardé ML. Isolation and genotyping of Toxoplasma gondii from different areas in Gabon. Young Researchers & Life Science Meeting, Paris, 23-25 Avril 2008.
Roy V, Mercier A, Demanche C et Harry M. Structure génétique du termite humivore Labiotermes labralis (Termitidae, Nasutitermitinae) en forêt fragmentée guyanaise. Petit pois déridé, Lille, 27 au 31 Août 2006.
Dardé ML, Mercier A et Ajzenberg D. Le toxoplasme en Afrique : Un génotype différent ? Une maladie différente ? Forum Pharmaceutique International, Brazzaville, Congo 1-3 Juin 2006.
Garrouste R, Mercier A, Nel A et Ensaf A. Le peuplement des termites (Isoptera) forestiers de La Réserve Naturelle de l'Amana, Guyane Française. Écosystèmes Forestiers des Caraïbes, Carib Congrès, Martinique, 5-10 Décembre 2005.

Communications affichées


Mercier A, Ajzenberg D, Durand P, Bañuls AL, Ngoubangoye B, Aubert D, Villena I, Dardé ML. Population structure of Toxoplasma gondii in Gabon. Deuxième journée scientifique de l'IFR GEIST, France, Limoges, 29 Janvier 2009.
Mercier A, Ajzenberg D, Durand P, Bañuls AL, Ngoubangoye B, Aubert D, Villena I, Dardé ML. Population structure of Toxoplasma gondii in Gabon. Toxoplasma Centennial Congress, Armação dos Búzios, Brésil, 21-24 Septembre 2008.
Mercier A, Aubert D, Roy V, Dumètre A, Ajzenberg D, Alarion N, de Sousa S, Costa J, Villena I, Dardé ML. Étude populationnelle d’isolats de toxoplasmes de Type II provenant d’animaux sauvages et domestiques en France et au Portugal. Première Journée Algéro-Française de Parasitologie, Alger, Algérie, 15-16 Novembre 2006.
Dumètre A, Ajzenberg D, Rozette L, Mercier A, Alarion N, Dardé ML. Toxoplasma gondii infection in sheep and free-range chickens from France: seroprevalence and isolate genotyping by microsatellite analysis. Congress: Toxoplasma and Food Safety 2006, Palermo, Sicily, Italy, 8-10 Mai 2006.
Hennequin S, Dajoz I, Mercier A, Dubuisson JY. Biodiversité en Forêt Tropicale Humide : utilisation des fougères Hymenophyllaceae comme Bio-indicateur à la Réunion. Journée Scientifique des IFRs & 12ème journée de la biologie de Paris 6, Paris, 31 Janvier et 1er Février 2005.

EXPERIENCES DE TERRAIN ET DE LABORATOIRE



2010 : D.I.U Formation à l’expérimentation animale de niveau 1 : Modèles animaux conventionnels et transgéniques pour la recherche biologique et médicale – technologie d’animalerie

ENS de Lyon et Université Lyon I

Direction : Denise Aubert, Émilie Auriol et Ludovic Say
2009 : Isolement de souche de Toxoplasma gondii en Guyane Française (6 mois sur le terrain)

EA 3593, Épidémiologie des Parasitoses Tropicales et Institut Pasteur de la Guyane

Direction : Bernard CARME
2007 : Isolement de souche de Toxoplasma gondii au Gabon (7 mois sur le terrain)

Centre International de recherche Médicale de Franceville

Direction : Marie-Laure Dardé et Philippe Blot
2005 : Isolement et caractérisation de marqueurs microsatellites chez Labiotermes labralis, Triatoma brasiliensis et Triatoma pseudomeculate aux génomes inconnus (6 mois en laboratoire)

UMR Biosol, Université Paris XII, Paris VI, IRD

Direction : Myriam Harry
2004 : Fouilles paléontologiques à la Caune de l’Arago à Tautavel (1 mois)

Direction : Henri de Lumley
2003 : Mission de recherche en Guyane française « Étude de la biodiversité de la Réserve Naturelle de l’Amana » (3 mois sur le terrain et 8 mois en laboratoire) :


  • Écologie des termites de Guyane au sein de la réserve naturelle de l’Amana

Laboratoire d’entomologie du Muséum national d’Histoire Naturelle

Direction : Romain Garrouste et André Nel


  • Inventaire et écologie des populations de termites et des hétéroptères de Guyane

Réserve Naturelle de l'Amana/Laboratoire d’entomologie du Muséum d’Histoire Naturelle

Direction : Romain Garrouste


  • Synécologie des arthropodes et de l’entomofaune de la réserve naturelle de l’Amana

Réserve Naturelle de l'Amana/Laboratoire d’entomologie du Muséum d’Histoire Naturelle

Direction : Romain Garrouste


  • Participation à l’étude de la maladie de Chagas dans la région du Nord-est de la Guyane

Réserve Naturelle de l'Amana/Laboratoire de parasitologie l’hôpital de Cayenne/Dispensaire d’Awala

Direction : Christine Aznar et Denis Blanchet


  • Participation à l’inventaire des micromammifères du 2ème cordon dunaire

Réserve Naturelle de l'Amana/ Laboratoire Paléontologie, Phylogénie et Paléobiologie, Institut des Sciences de l’Évolution, CNRS, Université de Montpellier II

Direction : François Catzeflis


  • Participation au suivi de la saison de ponte des Tortues marines (Campagne Kawana 2003)

Réserve Naturelle de l'Amana

Direction : Noémie Morgenstern
2003 : Inventaire écologique et floristique de terrain dans la Réserve de Mare Longue à la Réunion (10 jours)

Laboratoire de paléobotanique de l’UPMC

Direction : Jean-Yves Dubuisson et Isabelle Dajoz
2002-2010 : Bonnes compétences naturalistes développées dans le cadre des activités de l’association naturalistes Timarcha (Campus de Jussieu)

DOMAINES DE COMPÉTENCES TECHNIQUES ET SCIENTIFIQUES



Techniques de biologie moléculaire
- Extraction d’ADN à partir de divers types de matériels (tissus, sang, matière fécale)

- Clonage et développement de marqueurs microsatellites à partir d’ADN non connu

- PCR, génotypage de marqueurs microsatellites, séquençage
Méthodes de bioinformatique
Génétique des populations :
- Typage de marqueurs microsatellites (GeneMapper).

- Analyse de données (Genetix, Genepop on the web, STRUCTURE, FSTAT, Population, MEGA, TreeView)
Connaissances sur les méthodes d’analyse utilisant les Systèmes d’Information Géographique (SIG) et analyses spatiales (logiciel R)
Techniques d’animalerie
D.I.U Formation à l’expérimentation animale de niveau 1 
Techniques de terrain
Techniques de piégeage (+ manipulations et prélèvements sur animaux):
- Piégeages de micromammifères et de petits carnivores : pièges Sherman, BTS, Pitfall (formé par Francois Catzeflis)

- Piégeages d’arthropodes, notamment d’insectes : pièges lumineux (type drap blanc), PEC (piège entomologique composite), Pitfall
Techniques d’échantillonnage :
- Méthode de transect et quadra
Langues
Français : langue maternelle

Anglais : niveau scientifique

EXPÉRIENCES DIVERSES





  • Écovolontariat au Togo durant l’été 2004

  • Protagoniste du film "Curieux de Nature" réalisé par Stéphane Moscovicz (Production Entract). Première diffusion sur Arte le mardi 5 octobre 2004

  • Formation des gardes de la Réserve Naturelle de l’Amana à l’entomologie

  • Vulgarisation et animation en école primaire sur les arthropodes (généralité, élevages…)



CENTRES D’INTÉRET



Associations :


  • Conduite de randonnées au sein de l’Union touristique des Amis de la Nature

  • Membre actif de l’association naturaliste «Timarcha» de Paris VI

  • Périodiquement bénévole au musée de la Nature d’Allouville Bellefosse (association le C.H.E.N.E.)


Loisirs :


  • Pratiques sportives : escalade, parapente, vélo (déplacement), plongée (niveau 1)

  • Musique : cor d’harmonie (14 ans de conservatoire), niveau fin d’étude. Pratique en groupe et orchestre d’harmonie et symphonique

  • Connaissance en entomologie tropicale et tempérée (élevages), en ornithologie et en botanique (culture de plantes tropicales)

  • Pratiques de la terrariophilie et de l’aquariophilie


Autres :


  • Permis de conduire (1999).

  • Brevet national d’animateur de randonnée pédestre (FFRP). Août 1999

  • Brevet national de secourisme (Croix-Rouge française). Mai 1999 et repassé en Août 1999



RÉFÉRENCES



Recherche
Prof. Marie-Laure Dardé Laboratoire de parasitologie-mycologie CHU Dupuytren 2 av martin Luther King - 87042 limoges cedex, Tél. : +33 5 55 05 61 60, Fax : 05 55 05 61 77, Courriel : darde@unilim.fr
Dr. Daniel Ajzenberg Laboratoire de parasitologie-mycologie CHU Dupuytren 2 av martin Luther King - 87042 limoges cedex, Tél. : +33 5 55 05 61 60, Fax : +33 5 55 05 61 77, Courriel : AJZ@unilim.fr
Prof. Bernard Carme Laboratoire de parasitologie-mycologie CHU de Cayenne avenue des Flamboyants 97300 Cayenne, EA3593 (Epidémiologie des Parasitoses Tropicales) Faculté de Médecine, Université Antilles-Guyane à Cayenne, Tél. + 594 5 94 39 53 09, Courriel : carme.bernard@wanadoo.fr
Enseignement
Dr. Agnès Germot Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR1061) Faculté des Sciences et Techniques de Limoges, Tél: +33 5 55 45 76 57, Courriel : agnes.germot@unilim.fr
Dr. Fabrice Dupuy Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR1061) Faculté des Sciences et Techniques de Limoges, Tél: +33 5 55 45 76 67, Courriel : fabrice.dupuy@unilim.fr
Dr. Daniel Petit Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR1061) Faculté des Sciences et Techniques de Limoges, Tél: +33 5 55 45 75 34, Courriel : dpetit@unilim.fr
Dr. Anne Blondeau da Silva Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR1061) Faculté des Sciences et Techniques de Limoges, Tél: +33 5 55 45 76 75, Courriel : anne.blondeau@unilim.fr




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